殺菌滅藻劑對真菌的影響是多方麵的。它通常通過影響細菌的生長和分裂、孢子萌發、呼吸抑製、細胞膨脹、質體解體和細胞壁破壞來抑製或殺死生物體。

    殺菌滅藻劑的殺菌或抑菌作用主要與殺菌滅藻劑的性質、濃度和作用時間有關。

    1、 破壞細胞結構

    （1） 細胞壁損傷：殺菌滅藻劑使細胞壁纖維和鱗片變形，不能完成正常的生理功能。它們有的阻礙細胞壁的形成，使細胞壁解體，導致細胞質外露。

    （2） 細胞膜破壞：殺菌滅藻劑會增加或擴大膜疏水鏈的“鑲嵌”和裂縫，或殺菌滅藻劑分子的親脂部分溶解膜上的脂質部分形成微孔。季銨鹽殺菌滅藻劑就是這種作用，甚至膜上的金屬離子也被螯合破壞。

    2、 破壞線粒體的功能

    線粒體在細胞呼吸的能量儲存中起著重要作用。酚類物質可以抑製與氧化有關的酶和輔酶。二氯苯酚可與-SH反應，作用於輔酶A，阻止脂質氧化。有些殺菌滅藻劑破壞細胞內的氧化磷酸化偶聯反應，而酚類殺菌滅藻劑則有這種作用。

    （3） 代謝障礙的原因

    DNA、RNA和mRNA是遺傳和蛋白質合成的物質基礎。殺菌滅藻劑可以摻入核酸中，並可能抑製蛋白質合成。

    （4） 對酶係統的影響

    殺菌滅藻劑降低酶含量或酶活性，導致物質代謝失衡。例如，酚類物質在很低的濃度下會使某些酶失活，而另一些則會增加它們的活性，從而加劇新陳代謝異常，或引起人工反饋抑製，引起細菌中毒。

    （5） 與細胞內成分的相互作用

    這主要是指代謝物和殺菌滅藻劑之間的相互作用，如與細胞內最活躍的官能團SH反應，幹擾細胞內氧化還原過程，或螯合細胞內微量元素使某些酶失活。